基本上，玄鳳是屬於單一配偶的鳥類．經彼此中意而成功生育後代的對鳥會從此視對方為終生的配偶．所以在配對對鳥時，飼主應審慎選擇彼此有情意的對象．若為群養的玄鳳，飼主應以成鳥彼此間的情感為主要考慮要點．除了求偶行為時的明顯動作外，平常時，飼主可多加留意玄鳳間的互動關係．玄鳳間示好的行為有彼此間的互理羽翼行為，經常性地跟隨，允許對方與之共食，阻止其他追求者與之接觸，夜晚時在側睡眠等．選擇互有情意的成鳥後，可將從群養中分離並置於繁殖籠中以準備後續繁殖動作．

應避免配對對彼此有敵意並會攻擊的公母玄鳳成鳥．若公母玄鳳對彼此無情意時，再沒有其他成鳥供配對選擇下，飼主可先將之各別獨自隔離數日後，再將之安置於同籠數日，如此反覆數次以增強對彼此依賴的情感．於適當繁殖季節時日，可添加些許的促使發情的穀物，如麻的種子或蕎麥，和新鮮蔬果等．放置巢箱於籠子外附近亦可促使成年玄鳳有生育後代的欲望，若未確定該公母鳥有配對的意念時，則暫時不應將巢箱置於籠中，以防止母鳥獨自進巢生下未受精之蛋．若尚不能成功配對，飼主則應考慮是否另行配對．

應避免讓對鳥在一年內生育超過二胎．過度的生育會使母鳥的身體承受過多的負擔而危害其健康．因產下過多的蛋而流失過多鈣質時，會讓母鳥面臨虛弱，卡蛋，甚至死亡的危險．玄鳳的繁殖季節一般是從春天到初秋等有較長日光的日子．每次生育後，應該讓鳥父母有足夠時間休息來回復健康和體力．

玄鳳在遺傳學上的分類

不同羽色的玄鳳配對出來的後代有可能因混有親鳥特定的羽色基因而產生獨特的羽色變化．故有些飼主會為繁殖獨特的後代，而選擇特定的玄鳳成鳥配對．

在生物遺傳學領域中，玄鳳可區分３類．性聯遺傳基因，隱性基因和顯性基因．
性聯遺傳基因的玄鳳有：　黃化，珍珠，古銅，黃臉和白金．
隱性基因的玄鳳有：　　　派特，白臉，華勒，綠寶石和趴司度．
顯性基因的玄鳳有：　　　普通灰．
　　／有些稀有羽色帶銀的玄鳳和趴司度也會帶顯性基因／

基本的基因配對概念

除非是相當有配對玄鳳經驗或有遺傳學專業知識的飼主，才能有效地掌控配對下的幼鳥基因變化．雖非完全絕對，但基本的基因配對概念亦有其瞭解的必要． 基因乃成對而運作，組成幼鳥的基因為來自於父母雙方各一個基因．成對的基因為決定後代所有特徵的運作者，如性別，體型，羽色，個性及健康狀態等．

當描述基因時通常會引用X和Y的觀念．以決定幼鳥性別的基因為例，來自於父方的基因為唯一X，而來自於母方的基因則有可能為X或Y（無法預期得知）．當來自於母方的基因為X時，則與父方結合成XX；反之，當來自於母方的是Y時，則結合成XY．當幼鳥的性別基因為XX時，則其決定為雄性；反之當性別基因為XY時，則為雌性．故一般而言，幼鳥的性別為決定於母鳥．

如同決定性別的基因，不同基因則分別控制其他來自於父母雙方的特殊特徵，如羽色，於後代的發展．而這些帶有上一代特殊特徵的基因又因所屬顯性或隱性的不同而影響其呈現於後代的效果．一般而言，屬於顯性基因的特徵其所能影響後代的能力大過於隱性基因（特徵），當後代同時承襲顯性及隱性基因時，則只會呈現出顯性基因．反之，唯有帶隱性基因的父方與母方的結合，才能使其後代承襲其隱性的基因（特質）．

另一種影響上代基因（特徵）傳承的方式為性聯遺傳．該遺傳方式主要是受性別而決定．如同隱性基因般，當所屬於性聯遺傳的上代基因（特徵）欲傳承於雄性後代時，其父母雙方皆需帶該性聯基因，否則其雄性後代則無法呈現該基因特徵（雖難於外表上分辨出該特徵，但事實上該雄性後代本身亦帶其基因）．然而雌性後代則只需父方帶其性聯基因便能承襲該基因特徵．若雄性幼鳥所承襲自父母雙方的性聯基因屬於不同特徵時（如一為黃化，一為珍珠），則可能因彼此相抵制而造成原有的顯性基因呈現出．雌性幼鳥在同等情況（父母雙方的性聯基因屬於不同特徵時），則只會遺傳自父方的性聯基因特徵．母鳥身上所帶的性聯基因並不會傳承於後代（亦即XY中，代表母鳥的Y並不帶有性聯基因）．

隨著父母雙方所帶有的不同基因（特徵），其後代可能同時受到性聯遺傳（存在於決定性別的基因中）及其他基因（隱性基因）所帶的特徵所影響．舉例來說，當父母雙方個別帶有性聯遺傳基因（如黃化）及隱性基因（如白臉）時，則會導致其後代有出現全身呈白色的羽色，然其外表雖如白子樣，但實際上則是因在受性聯基因（黃化，除去黑色素）及隱性基因（白臉，除去脂色素，即黃色及橘色）的雙重作用下所產生的結果．

除去多重基因（同時受性聯及隱性基因的影響），一般基本的基因配對下所產生的後代羽色結果會更能被預期．如：

　　　　　　顯性基因＊顯性基因　＝　１００％的顯性基因後代
　　　　　　性聯基因＊性聯基因　＝　１００％的性聯基因後代
　性聯基因（公）＊顯性基因（母）＝　５０％帶羽色變化 （帶性聯基因）的顯性基因公鳥
　　　　　　　　　　　　　　　　　　５０％帶性聯基因的母鳥
　性聯基因（母）＊顯性基因（公）＝　５０％帶羽色變化的顯性基因公鳥
　　　　　　　　　　　　　　　　　　５０％帶顯性基因的母鳥
　　　　　　隱性基因＊隱性基因　＝　１００％的隱性基因後代
　　　　　　隱性基因＊顯性基因　＝　１００％帶羽色變化的後代　
　　　　　　　　／以上所指之顯性基因單指普通灰玄鳳／

然而專為基因改良配對的飼主其著重者，通常都不在這些範圍內，而是在 較為複雜的性聯基因和隱性基因的配對．

在這類的基因配對下，後代幼鳥的羽色變化從親鳥任一方的羽色到兩者羽色的調和，甚或於異於親鳥的羽色變化都有可能．若想配對成某特定的後代，牽涉到所謂的交叉配對或上代親鳥基因並須本身對遺傳學有相當的認知．一般飼主應不用勞心於此．若飼主對基因配對有興趣可多參閱遺傳基因學的書籍．

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